90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1813 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 115 aa  236  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  57.89 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  53.54 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  51.92 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  53.54 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  60.44 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  58.24 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  58.24 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  51.89 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  60.2 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  51.85 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  54.81 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  56.52 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  50.91 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  51.96 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  56.04 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  49 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  48.48 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  54.29 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  49.11 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  58.33 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  46.36 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  51.06 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  47.57 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  47.32 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  53.12 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  61.8 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  45.26 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  51.16 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  40.22 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  28.16 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.406896 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  26.8 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  28.85 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  28.85 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  26.8 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  26.8 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  26.8 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  26.8 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  26.8 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  29.25 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  27.84 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4011  hypothetical protein  30.1 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  28.95 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  28.95 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  24.32 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  31.37 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  28.3 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  27.78 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  26.67 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  29.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  29.41 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  27.88 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  26.26 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0275  hypothetical protein  29.73 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  29.76 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  28.28 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  29.52 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  26.92 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  26.26 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  28.28 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  27.08 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  28 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  26 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  28.57 
 
 		 107 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>