More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1754 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1754  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
324 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1217  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  40.3 
 
 
330 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal  0.131023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0297  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.92 
 
 
354 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.13 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0913  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.33 
 
 
331 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0926548  decreased coverage  0.00569345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0906  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  39.02 
 
 
331 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0923  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.02 
 
 
331 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.42 
 
 
330 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5126  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.18 
 
 
330 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3718  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.42 
 
 
330 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0970  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.02 
 
 
342 aa  195  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.609858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.39 
 
 
322 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.26 
 
 
322 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.54 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.12 
 
 
339 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.01 
 
 
339 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.09 
 
 
322 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.72 
 
 
370 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  32.14 
 
 
366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.24 
 
 
324 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.39 
 
 
331 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  30.84 
 
 
384 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.76 
 
 
368 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
358 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.26 
 
 
323 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.44 
 
 
357 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.46 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.63 
 
 
326 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.63 
 
 
436 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1248  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.35 
 
 
321 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0484421  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.47 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.57 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.78 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.49 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.49 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.49 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.45 
 
 
404 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.27 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  30.16 
 
 
372 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.77 
 
 
331 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.79 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.27 
 
 
325 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.92 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.65 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.08 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.38 
 
 
367 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.13 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  27.94 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.84 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.91 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  28.53 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.28 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 
365 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.96 
 
 
380 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  30.46 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.61 
 
 
323 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.61 
 
 
323 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.3 
 
 
367 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.45 
 
 
417 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.24 
 
 
325 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.46 
 
 
327 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.93 
 
 
333 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.79 
 
 
387 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1910  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.91 
 
 
334 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.69 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.8 
 
 
358 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.64 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  29.28 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  29.5 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  28.8 
 
 
325 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.13 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.49 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.64 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  29.32 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.62 
 
 
324 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.3 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.89 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.86 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  28.15 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.61 
 
 
368 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3668  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.59 
 
 
304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.71 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.79 
 
 
338 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.12 
 
 
367 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  28 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  28 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.55 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  31.46 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  28.29 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.39 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  30 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.19 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.18 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  24.5 
 
 
316 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.42 
 
 
323 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.5 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.5 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.18 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.84 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>