More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1741 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1741  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 523 aa  1046    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1591  amino acid permease-associated region  61.93 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340007  normal  0.272695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0454  amino acid permease-associated region  45.79 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  45.85 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1554  amino acid permease-associated region  45.26 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3069  amino acid permease-associated region  44.86 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1983  amino acid transporter  42.2 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4301  amino acid permease-associated region  43.79 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4065  amino acid permease-associated region  43.79 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3457  amino acid permease-associated region  44.03 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3458  amino acid permease-associated region  44.65 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10351  L-asparagine permease ansP2  44.6 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01410  L-asparagine transporter  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00425932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2193  amino acid permease-associated region  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  41.98 
 
 		 509 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  41.98 
 
 		 509 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1725  L-asparagine permease  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572369  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  41.98 
 
 		 509 aa  382  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2206  amino acid permease-associated region  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000670544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2059  L-asparagine permease  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0501349  hitchhiker  0.00455719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1540  L-asparagine permease  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3965  amino acid permease-associated region  44.65 
 
 		 497 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01421  hypothetical protein  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00419609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3417  amino acid permease-associated region  42.47 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1635  L-asparagine permease  44.97 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  47.71 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  43.33 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1718  L-asparagine permease  45.17 
 
 		 499 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1763  L-asparagine permease  44.58 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0655306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1757  L-asparagine permease  44.58 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000130352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1576  L-asparagine permease  44.58 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000285451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1702  L-asparagine permease  44.76 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000149033  normal  0.155266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3273  amino acid permease-associated region  44.74 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3977  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0873  amino acid permease-associated region  41.86 
 
 		 483 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  44.58 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2097  amino acid permease-associated region  44.97 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3759  amino acid permease-associated region  47.2 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12159  L-asparagine permease ansP1  44.65 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0029057  normal  0.731439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3270  amino acid permease-associated region  43.67 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1499  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 		 617 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6995  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6330  amino acid permease-associated region  44.47 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.80372  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3400  amino acid permease-associated region  45.15 
 
 		 489 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3549  amino acid permease-associated region  46.38 
 
 		 504 aa  345  8e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4431  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1347  amino acid permease-associated region  44.42 
 
 		 487 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000251432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20750  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  43.79 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0330328  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 475 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5754  amino acid permease-associated region  42.55 
 
 		 490 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  normal  0.385006 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  38.57 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  37.19 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  38.57 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  38.57 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  38.57 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  38.34 
 
 		 461 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  38.79 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  40.04 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  40.04 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  40.04 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  38.93 
 
 		 461 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  39.56 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  38.22 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.29 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  38.74 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  38.68 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  38.12 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  41.12 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  37.5 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  39.73 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  38.08 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  41.12 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  37.5 
 
 		 463 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  37.5 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  37.5 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  37.5 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  37.5 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  37.27 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  39.91 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  37.27 
 
 		 463 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 463 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  38.6 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  38.6 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  38.6 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  37.05 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  38.04 
 
 		 471 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  38.58 
 
 		 456 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  38.85 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  38.58 
 
 		 456 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0164  aromatic amino acid transporter  38.58 
 
 		 456 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0168  aromatic amino acid transporter  38.58 
 
 		 456 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  38.58 
 
 		 456 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>