More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1632 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  68.9 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  67.25 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  67.46 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  66.99 
 
 		 239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  66.99 
 
 		 239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  66.99 
 
 		 239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  64.45 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  58.96 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  57.29 
 
 		 307 aa  218  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  58.85 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  56.37 
 
 		 275 aa  208  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  56.59 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  56.52 
 
 		 269 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  57.55 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  55.61 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  55.98 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  57 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  54.59 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  50.45 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  55.24 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  53.96 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.5 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  46 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.69 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 199 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  41.58 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.79 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.57 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  44.56 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  43.56 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  45.65 
 
 		 207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.57 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 197 aa  151  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  44.44 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  40.69 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  36.89 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  44.09 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  39.42 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  44.64 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  46.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>