More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1518 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
505 aa  995    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  60.97 
 
 
515 aa  581  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  63.89 
 
 
513 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  63.89 
 
 
513 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  63.89 
 
 
513 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2938  leucyl aminopeptidase  62.3 
 
 
505 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3575  leucyl aminopeptidase  65.58 
 
 
510 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00437007  normal  0.0600752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  57.45 
 
 
498 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12241  leucyl aminopeptidase  61.32 
 
 
515 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.299314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1354  Leucyl aminopeptidase  56.68 
 
 
499 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  50.1 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  51.65 
 
 
490 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  46.86 
 
 
508 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  46.76 
 
 
507 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3358  Leucyl aminopeptidase  52.13 
 
 
502 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  48.33 
 
 
545 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1271  leucyl aminopeptidase  47.29 
 
 
502 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.609468  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3549  leucyl aminopeptidase  50.74 
 
 
521 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.984624  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  53.14 
 
 
492 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 
490 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0945  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 
495 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.593268  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  48.17 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0995  leucyl aminopeptidase  50.51 
 
 
499 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.842582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1867  Leucyl aminopeptidase  56.47 
 
 
505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00187713  decreased coverage  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3317  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
521 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614561  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  51.19 
 
 
499 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3133  leucyl aminopeptidase  47.32 
 
 
531 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.100377  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1834  leucyl aminopeptidase  45.56 
 
 
506 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13310  leucyl aminopeptidase  46.75 
 
 
510 aa  344  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3276  Leucyl aminopeptidase  51.17 
 
 
499 aa  345  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187039  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  50.98 
 
 
493 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  48.33 
 
 
497 aa  333  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2098  Leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.827384  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0937  leucyl aminopeptidase  47.85 
 
 
537 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.104658  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.08 
 
 
511 aa  322  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1781  leucyl aminopeptidase  51.65 
 
 
537 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228538  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16320  leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
524 aa  296  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197176  normal  0.502851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
492 aa  289  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  39.07 
 
 
497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.39 
 
 
491 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.13 
 
 
501 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  39.26 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  36.62 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  39.46 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 
491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 
492 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
497 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  35.85 
 
 
496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  41.35 
 
 
496 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  43.93 
 
 
485 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.23 
 
 
496 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
497 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  43.43 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  40.55 
 
 
505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0837  Leucyl aminopeptidase  35.45 
 
 
483 aa  265  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.775484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
487 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  38.85 
 
 
491 aa  264  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
488 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  43.41 
 
 
616 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  41.24 
 
 
511 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
496 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  37.52 
 
 
497 aa  261  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  37.28 
 
 
512 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  42.71 
 
 
502 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  33.87 
 
 
501 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1046  leucyl aminopeptidase  34.55 
 
 
486 aa  259  9e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.299519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 
496 aa  259  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  37.95 
 
 
500 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  38.3 
 
 
497 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  36.83 
 
 
497 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.31 
 
 
493 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  43.09 
 
 
530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  38.33 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 
489 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 
492 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 
497 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  37.09 
 
 
524 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
522 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  41.13 
 
 
503 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 
495 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  39.2 
 
 
474 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 
496 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1104  Leucyl aminopeptidase  43.91 
 
 
503 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  38.86 
 
 
478 aa  251  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  42.82 
 
 
518 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  37.78 
 
 
497 aa  250  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  38.06 
 
 
500 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  34.65 
 
 
493 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  38.48 
 
 
495 aa  249  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  43.2 
 
 
485 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  40.9 
 
 
503 aa  249  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  37.2 
 
 
496 aa  249  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  34.31 
 
 
506 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  39.41 
 
 
501 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  36.48 
 
 
499 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  38.16 
 
 
498 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>