More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1472 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  70.62 
 
 		 987 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  67.21 
 
 		 1016 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  67.11 
 
 		 1041 aa  701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  65.71 
 
 		 1018 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1040 aa  2055    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  58.48 
 
 		 1007 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  69.29 
 
 		 1058 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  65.94 
 
 		 974 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  67.98 
 
 		 1244 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  70.69 
 
 		 1048 aa  682    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  62.68 
 
 		 717 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  67 
 
 		 990 aa  681    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  62.95 
 
 		 1024 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  66.13 
 
 		 1427 aa  720    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  66.22 
 
 		 1043 aa  690    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  69.93 
 
 		 961 aa  791    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  70.74 
 
 		 1194 aa  723    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  57.63 
 
 		 1123 aa  936    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  70.62 
 
 		 991 aa  803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  67.45 
 
 		 953 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  63.33 
 
 		 952 aa  687    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  68.13 
 
 		 922 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  69.04 
 
 		 944 aa  680    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  70.71 
 
 		 1080 aa  697    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  66.8 
 
 		 1113 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  64.56 
 
 		 1334 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  66.6 
 
 		 702 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  71.48 
 
 		 1093 aa  756    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  66.09 
 
 		 1265 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  70.62 
 
 		 991 aa  803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  66.32 
 
 		 959 aa  635  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  62.55 
 
 		 908 aa  609  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  56.81 
 
 		 1022 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  55.98 
 
 		 1093 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  49.76 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.61 
 
 		 494 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  43.72 
 
 		 564 aa  322  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  42.2 
 
 		 559 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  42.09 
 
 		 562 aa  307  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.59 
 
 		 492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.34 
 
 		 483 aa  303  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.21 
 
 		 636 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.26 
 
 		 543 aa  301  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  43.5 
 
 		 416 aa  299  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  40.35 
 
 		 1074 aa  296  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.86 
 
 		 497 aa  296  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  41.25 
 
 		 1057 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  43.14 
 
 		 571 aa  296  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  41.13 
 
 		 411 aa  295  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.24 
 
 		 503 aa  294  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40.38 
 
 		 503 aa  294  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.32 
 
 		 497 aa  293  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  39.9 
 
 		 1012 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  41.25 
 
 		 1073 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  39.6 
 
 		 1238 aa  292  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.55 
 
 		 497 aa  291  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40 
 
 		 499 aa  290  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  39.3 
 
 		 1128 aa  290  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.24 
 
 		 496 aa  290  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.24 
 
 		 496 aa  290  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  40.59 
 
 		 1007 aa  290  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.58 
 
 		 496 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  40.58 
 
 		 491 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  39 
 
 		 1175 aa  288  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2657  ribonuclease, Rne/Rng family  40.9 
 
 		 1154 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00498519  hitchhiker  0.000418055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.93 
 
 		 1056 aa  287  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  37.41 
 
 		 866 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  39.36 
 
 		 1038 aa  287  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1710  ribonuclease  40.9 
 
 		 1144 aa  287  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000580294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.71 
 
 		 531 aa  287  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  42.18 
 
 		 1139 aa  287  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  41.21 
 
 		 968 aa  287  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1750  ribonuclease  40.9 
 
 		 1158 aa  287  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00127119  normal  0.447333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  38.57 
 
 		 1071 aa  287  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2785  ribonuclease E  40.9 
 
 		 1088 aa  287  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  39.36 
 
 		 530 aa  287  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  40.96 
 
 		 938 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  41.13 
 
 		 496 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1707  ribonuclease  40.9 
 
 		 1148 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  38.54 
 
 		 1059 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  39.5 
 
 		 1128 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  38.81 
 
 		 1142 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  38.54 
 
 		 1053 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  40.59 
 
 		 489 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  40.9 
 
 		 1128 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2405  RNAse E  38.96 
 
 		 1093 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  40.59 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2567  RNAse E  38.96 
 
 		 1098 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  38.78 
 
 		 1111 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  38.93 
 
 		 1092 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.56 
 
 		 1076 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  39.15 
 
 		 1120 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40 
 
 		 489 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  39.35 
 
 		 1132 aa  285  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.34 
 
 		 496 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  38.21 
 
 		 1102 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  38.54 
 
 		 1056 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.09 
 
 		 492 aa  285  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  38.78 
 
 		 1068 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  38.98 
 
 		 501 aa  284  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>