164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1443 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 470 aa  899    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  63.33 
 
 		 619 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  43.57 
 
 		 611 aa  333  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  40.35 
 
 		 608 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  43.98 
 
 		 614 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  40.27 
 
 		 608 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  39.73 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  39.73 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  40.04 
 
 		 608 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 		 615 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  38.43 
 
 		 609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  43.12 
 
 		 615 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  41.03 
 
 		 608 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  39.1 
 
 		 585 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  40.49 
 
 		 608 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  40.27 
 
 		 608 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  40.27 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  40.27 
 
 		 608 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  40.41 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 614 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  40.04 
 
 		 608 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  42.52 
 
 		 672 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  42.95 
 
 		 647 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  42.44 
 
 		 622 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  40.58 
 
 		 611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  39.38 
 
 		 612 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  38.93 
 
 		 614 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  43.39 
 
 		 750 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  37.07 
 
 		 615 aa  279  6e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  39.86 
 
 		 693 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 		 627 aa  276  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  36.9 
 
 		 629 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  35.7 
 
 		 629 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.12 
 
 		 777 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.69 
 
 		 781 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  40 
 
 		 668 aa  267  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  37.33 
 
 		 612 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  37.39 
 
 		 614 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  39.82 
 
 		 677 aa  261  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 664 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 664 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 664 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.78 
 
 		 627 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  40.35 
 
 		 683 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  38.38 
 
 		 731 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  37.53 
 
 		 674 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  39.64 
 
 		 672 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  40.05 
 
 		 674 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  37.89 
 
 		 655 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  36.89 
 
 		 682 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  43.71 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  37.85 
 
 		 672 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  38.21 
 
 		 654 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  37.97 
 
 		 774 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  36.61 
 
 		 664 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  39.74 
 
 		 696 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 653 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  37.34 
 
 		 658 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  37.2 
 
 		 678 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  40.28 
 
 		 691 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  35.43 
 
 		 685 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  38.25 
 
 		 657 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.19 
 
 		 815 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  38.25 
 
 		 667 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  37.12 
 
 		 677 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  37.72 
 
 		 681 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  38.61 
 
 		 704 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 		 664 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  38.34 
 
 		 678 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  36.48 
 
 		 667 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  33.56 
 
 		 713 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  33.56 
 
 		 713 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.65 
 
 		 657 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 		 657 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  43.66 
 
 		 253 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.73 
 
 		 656 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  29.41 
 
 		 647 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  29.41 
 
 		 647 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  33.4 
 
 		 650 aa  137  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  28.04 
 
 		 680 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  26.45 
 
 		 680 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  28.22 
 
 		 685 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  34.23 
 
 		 657 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  33.96 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  33.6 
 
 		 655 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  43.75 
 
 		 101 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.73 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.51 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  31.45 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  31.45 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  31.45 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  32.95 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  20.87 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  20.61 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  20.42 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  20.05 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>