More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1424 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  68.5 
 
 		 209 aa  250  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  46.63 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 		 380 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  45.67 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  41.26 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  42 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  38.81 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  35.83 
 
 		 318 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  36.57 
 
 		 283 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  40.4 
 
 		 185 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.36 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 445 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.8 
 
 		 515 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  35.05 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  34.24 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  41.72 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.51 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  32.07 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  36.54 
 
 		 522 aa  85.9  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  35.95 
 
 		 293 aa  85.1  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  38.56 
 
 		 528 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  38.56 
 
 		 528 aa  84.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.88 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  35.9 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  36.67 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.51 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  39.38 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  33.01 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.74 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  34.78 
 
 		 462 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  34.29 
 
 		 462 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  31.87 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  31.87 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  38 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  29.03 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  38 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  36.36 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.8 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.49 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  37.5 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.18 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  34.78 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  34.12 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  34.12 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  34.12 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  32.31 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  38.56 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  35.67 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  29.68 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.85 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.85 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  32.42 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  39.07 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 568 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.78 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  32.99 
 
 		 537 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  35.71 
 
 		 506 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  33.18 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  40.79 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  39.47 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.16 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  31.84 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.33 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  35.95 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  31.84 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  31.84 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  36.59 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  34.36 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  34.36 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  33.33 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.96 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.26 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  33.33 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  35.54 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>