20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1395 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1395  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  313  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00858881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2034  hypothetical protein  60.26 
 
 
164 aa  163  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3612  hypothetical protein  46.25 
 
 
161 aa  127  8e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3680  hypothetical protein  46.25 
 
 
161 aa  127  8e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3607  hypothetical protein  46.25 
 
 
161 aa  127  8e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4061  hypothetical protein  47.13 
 
 
158 aa  127  9e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2575  hypothetical protein  45.22 
 
 
158 aa  123  8e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12493  hypothetical protein  41.72 
 
 
167 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.226542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1141  hypothetical protein  41.45 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11860  protein of unknown function (DUF477)  39.74 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1545  protein of unknown function DUF477  39.5 
 
 
154 aa  77.4  8e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3893  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  74.3  6e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3518  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  73.2  2e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1827  hypothetical protein  37.4 
 
 
152 aa  70.1  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4628  hypothetical protein  33.62 
 
 
140 aa  69.3  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0203811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7337  hypothetical protein  30.33 
 
 
129 aa  54.7  5e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0971863  hitchhiker  0.000142423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5307  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  51.2  6e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393038  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1599  hypothetical protein  31.71 
 
 
150 aa  50.8  7e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233492  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1380  hypothetical protein  28.83 
 
 
129 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1159  hypothetical protein  30.09 
 
 
145 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>