More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1357 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 393 aa  783    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  70.39 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  69.84 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  64.02 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  49.74 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  42.82 
 
 		 394 aa  302  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  36.29 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  35.9 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  36.03 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  36.81 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.99 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  34.99 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  34.99 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  36.39 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  36.98 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 376 aa  209  8e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  37.24 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.1 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  33.68 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  38.28 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.55 
 
 		 382 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  32.94 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  37.63 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  31.82 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  32.65 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  35.7 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  29.5 
 
 		 359 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.2 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  33.52 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  38.85 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  33.42 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  32.74 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.99 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  32.06 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.01 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  32.23 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.9 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 		 374 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 390 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.67 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  27.42 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>