More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1353 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
629 aa  1264    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  68.39 
 
 
634 aa  865    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  66.67 
 
 
631 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  65.4 
 
 
629 aa  823    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  68.95 
 
 
626 aa  871    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  57.89 
 
 
642 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.52 
 
 
626 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  39.87 
 
 
646 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.64 
 
 
706 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.95 
 
 
924 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  37.4 
 
 
640 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  37.08 
 
 
655 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.59 
 
 
907 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.29 
 
 
630 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  39.75 
 
 
694 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.4 
 
 
632 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.03 
 
 
705 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.41 
 
 
641 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.4 
 
 
636 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.23 
 
 
644 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.16 
 
 
655 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.95 
 
 
626 aa  362  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.75 
 
 
731 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.63 
 
 
626 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.5 
 
 
626 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.75 
 
 
686 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  32.59 
 
 
759 aa  335  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.7 
 
 
688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.92 
 
 
682 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.7 
 
 
686 aa  319  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.85 
 
 
632 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  34.12 
 
 
681 aa  310  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.02 
 
 
666 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.82 
 
 
656 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.77 
 
 
632 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.77 
 
 
665 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.17 
 
 
638 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.54 
 
 
650 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.03 
 
 
665 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.02 
 
 
623 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.73 
 
 
615 aa  220  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.13 
 
 
653 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  27.84 
 
 
642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.79 
 
 
656 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.61 
 
 
657 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  30.96 
 
 
649 aa  207  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
661 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.6 
 
 
659 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.11 
 
 
662 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  29.12 
 
 
657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  29.44 
 
 
662 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.6 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  24.88 
 
 
645 aa  198  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.77 
 
 
649 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.42 
 
 
662 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.72 
 
 
662 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.24 
 
 
665 aa  193  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.9 
 
 
650 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.69 
 
 
646 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 
661 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.1 
 
 
644 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.86 
 
 
600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.21 
 
 
594 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.39 
 
 
645 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.39 
 
 
645 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.39 
 
 
645 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  28.14 
 
 
653 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.19 
 
 
645 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.5 
 
 
654 aa  187  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.66 
 
 
755 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.81 
 
 
652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.14 
 
 
678 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.09 
 
 
662 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  27.17 
 
 
638 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  33.12 
 
 
648 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27 
 
 
688 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.28 
 
 
610 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  37.65 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 
642 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.81 
 
 
645 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.41 
 
 
597 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.12 
 
 
634 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.34 
 
 
629 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.71 
 
 
638 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  32.89 
 
 
665 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 
685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  26.38 
 
 
636 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.82 
 
 
612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.36 
 
 
628 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.46 
 
 
653 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.32 
 
 
588 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.98 
 
 
607 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.86 
 
 
611 aa  158  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 
656 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.92 
 
 
695 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.78 
 
 
621 aa  154  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.22 
 
 
596 aa  153  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>