85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1227 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1039    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.96 
 
 
691 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  30.43 
 
 
552 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  19.5 
 
 
650 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  19.1 
 
 
632 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  19.01 
 
 
632 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  32.5 
 
 
609 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  34.71 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  39.39 
 
 
369 aa  77  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.47 
 
 
719 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  31.79 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  35.29 
 
 
371 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  32.61 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  34.12 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.21 
 
 
746 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  30.43 
 
 
375 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.27 
 
 
651 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.27 
 
 
651 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  36.49 
 
 
376 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  36.94 
 
 
358 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  34.71 
 
 
375 aa  64.3  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.88 
 
 
695 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.32 
 
 
695 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.32 
 
 
695 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.32 
 
 
695 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.32 
 
 
695 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  33.04 
 
 
357 aa  60.1  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.88 
 
 
695 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  28.38 
 
 
361 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  28.38 
 
 
361 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  57  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  31.25 
 
 
367 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.96 
 
 
696 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  27.03 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  37.5 
 
 
379 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  37.78 
 
 
363 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.14 
 
 
706 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.55 
 
 
706 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.55 
 
 
706 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  36.3 
 
 
372 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.74 
 
 
730 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  21.75 
 
 
721 aa  51.2  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  28.21 
 
 
600 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  24.62 
 
 
638 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.43 
 
 
717 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  30.94 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  30.97 
 
 
631 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.78 
 
 
727 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  25.34 
 
 
717 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.78 
 
 
727 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  31.16 
 
 
372 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  26.11 
 
 
725 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.81 
 
 
746 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  25.68 
 
 
700 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  25.68 
 
 
700 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.68 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.68 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.68 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.68 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.68 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.68 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  28.57 
 
 
647 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.11 
 
 
696 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  30.54 
 
 
361 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  26.48 
 
 
758 aa  47  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3344  hypothetical protein  31.01 
 
 
632 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000196875  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  24.37 
 
 
638 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  28.51 
 
 
374 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  26.54 
 
 
733 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.94 
 
 
677 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  31.17 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  28.48 
 
 
638 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.36 
 
 
737 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.39 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.78 
 
 
660 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.72 
 
 
699 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  28.24 
 
 
377 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  22.62 
 
 
681 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  28.24 
 
 
377 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  28.22 
 
 
700 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  26.63 
 
 
758 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  26.63 
 
 
758 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  26.63 
 
 
758 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.21 
 
 
740 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>