More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1162 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  363  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11229  hypothetical protein  57.56 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  58.38 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  57.23 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  58.38 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  58.38 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  58.38 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3313  hypothetical protein  55.56 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2184  hypothetical protein  59.54 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000227609  normal  0.582537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  51.4 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  51.72 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  52.87 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  50.99 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  54.07 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  54.39 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  45.51 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  41.14 
 
 		 197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  47.68 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  51.18 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  47.74 
 
 		 200 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  47.8 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  42.51 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  42.51 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  42.86 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  43.32 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  41.11 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  41.34 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  46.34 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  47.89 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  48.61 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  42.93 
 
 		 195 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  39.26 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  39.11 
 
 		 225 aa  130  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  43.4 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  39.11 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  47.02 
 
 		 440 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  37.22 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  45.51 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  42.21 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  42.21 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  42.95 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  41.4 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  41.56 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  43.48 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  39.18 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  42.77 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  48.85 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  40.91 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  43.23 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  41.56 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  38.71 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  42.58 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  42.58 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  38.71 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  42.68 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  39.87 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  42.24 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  43.93 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  41.71 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  41.94 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  41.57 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  41.57 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  45.39 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  45.1 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  44.52 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  45.1 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  42.29 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  36.72 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  45.09 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  42.58 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  44.52 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  40.67 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  41.48 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  39.35 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  42.58 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  41.29 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  43.59 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  41.77 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  44.87 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  41.51 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  38.06 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  41.03 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  37.91 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  38.59 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  35.96 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  37.57 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  40.13 
 
 		 198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  37.02 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  40.65 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  37.64 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.81 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  37.97 
 
 		 199 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>