More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1159 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  100 
 
 
450 aa  877    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  63.12 
 
 
452 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  57.73 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  51.13 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  51.67 
 
 
450 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  45.91 
 
 
444 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  43.02 
 
 
465 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  47.48 
 
 
451 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  45.12 
 
 
447 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  40.42 
 
 
465 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  36.47 
 
 
449 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  34.47 
 
 
444 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  43.85 
 
 
446 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  36.12 
 
 
468 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  40 
 
 
463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  38.3 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  38.3 
 
 
462 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  36.74 
 
 
460 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  41.36 
 
 
473 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  37.18 
 
 
466 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  32.88 
 
 
443 aa  279  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  34.14 
 
 
458 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  38.07 
 
 
463 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  37.03 
 
 
460 aa  277  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  38.44 
 
 
460 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  37.5 
 
 
460 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  34.99 
 
 
468 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  37.83 
 
 
460 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.73 
 
 
468 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  36.32 
 
 
460 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  34.57 
 
 
469 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  36.32 
 
 
463 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  35.2 
 
 
468 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  32.16 
 
 
456 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  36.36 
 
 
460 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.89 
 
 
446 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  35.02 
 
 
447 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.57 
 
 
446 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  37.73 
 
 
460 aa  259  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  35.33 
 
 
469 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  35.11 
 
 
469 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  33.92 
 
 
458 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  36.88 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  34.24 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.55 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  32.49 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  30.23 
 
 
455 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  33.71 
 
 
454 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  35.73 
 
 
454 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  33.18 
 
 
449 aa  243  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  34.84 
 
 
450 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  30.66 
 
 
454 aa  240  4e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  34.74 
 
 
486 aa  240  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.54 
 
 
453 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  37.12 
 
 
486 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  35.38 
 
 
449 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  33.85 
 
 
447 aa  235  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  34.92 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  34.92 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  35.51 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  35.75 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  36.55 
 
 
471 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  34.7 
 
 
461 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  30.13 
 
 
454 aa  232  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  30.99 
 
 
447 aa  230  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  35.78 
 
 
462 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  35.87 
 
 
456 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  33.18 
 
 
454 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  36.96 
 
 
455 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  34.7 
 
 
454 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  34.99 
 
 
447 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  33.86 
 
 
456 aa  225  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  33.73 
 
 
457 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  35.96 
 
 
473 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.25 
 
 
463 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  30.99 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  33.7 
 
 
456 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  33.79 
 
 
456 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  33.78 
 
 
452 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  34.35 
 
 
452 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  36.8 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  35.66 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  35.98 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  35.98 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  32.17 
 
 
457 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  30.55 
 
 
442 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  34.45 
 
 
460 aa  216  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  34.49 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  33.79 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  33.49 
 
 
454 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  29.69 
 
 
442 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  35.4 
 
 
461 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  32.44 
 
 
458 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  30.21 
 
 
482 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  29.71 
 
 
458 aa  204  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  32.71 
 
 
445 aa  203  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.67 
 
 
451 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  33.56 
 
 
456 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  33.79 
 
 
461 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  31.65 
 
 
473 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>