More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1114 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.78 
 
 
263 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.69 
 
 
264 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  73.93 
 
 
266 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.92 
 
 
267 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.92 
 
 
267 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.29 
 
 
242 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.27 
 
 
326 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.41 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75 
 
 
328 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.04 
 
 
274 aa  291  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.8 
 
 
329 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 
257 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  43.95 
 
 
249 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.63 
 
 
266 aa  215  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.14 
 
 
302 aa  214  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.92 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.01 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.59 
 
 
255 aa  211  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.57 
 
 
298 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 
297 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.31 
 
 
298 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.8 
 
 
255 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.72 
 
 
294 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.53 
 
 
317 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 
302 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.96 
 
 
254 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.31 
 
 
303 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  45.91 
 
 
290 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.76 
 
 
253 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.21 
 
 
299 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.78 
 
 
257 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  45.14 
 
 
319 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.51 
 
 
309 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  41.7 
 
 
332 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  44.36 
 
 
293 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.34 
 
 
339 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  43.78 
 
 
294 aa  205  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.53 
 
 
303 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.56 
 
 
253 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.19 
 
 
322 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  44.58 
 
 
253 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  44.03 
 
 
258 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.3 
 
 
362 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  42.68 
 
 
348 aa  202  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.06 
 
 
262 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.49 
 
 
255 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.65 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  44.62 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  47.97 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  43.7 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  44.53 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  42.57 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.92 
 
 
259 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.75 
 
 
268 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  45.45 
 
 
330 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.41 
 
 
307 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  43.4 
 
 
327 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.8 
 
 
307 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.09 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  44.76 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  47.22 
 
 
370 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  44.76 
 
 
253 aa  198  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.02 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.35 
 
 
470 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  43.65 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  43.67 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.4 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.31 
 
 
253 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.25 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.53 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.19 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.9 
 
 
253 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.53 
 
 
256 aa  195  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.5 
 
 
257 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.55 
 
 
253 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.74 
 
 
284 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.06 
 
 
267 aa  194  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  41.13 
 
 
253 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
254 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  39.84 
 
 
257 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  39.84 
 
 
257 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.15 
 
 
253 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  39.13 
 
 
258 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  44.96 
 
 
314 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.53 
 
 
337 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  43.62 
 
 
266 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  42.45 
 
 
253 aa  192  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>