More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1077 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 554 aa  1097    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  66.27 
 
 		 557 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.08 
 
 		 552 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.69 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.69 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  63.82 
 
 		 567 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.35 
 
 		 547 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.09 
 
 		 551 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  52.3 
 
 		 577 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  54.13 
 
 		 801 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 		 581 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  48.72 
 
 		 648 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  48.93 
 
 		 594 aa  422  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  44.81 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  47.28 
 
 		 579 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  48.16 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  44.36 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  47.78 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.64 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  46.51 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  39.7 
 
 		 597 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  54.12 
 
 		 608 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  44.02 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 574 aa  356  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 601 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  52.79 
 
 		 558 aa  339  8e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  45.22 
 
 		 587 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 607 aa  312  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 538 aa  276  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 565 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.07 
 
 		 468 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  35.19 
 
 		 505 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  34.94 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.07 
 
 		 460 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 364 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  35.96 
 
 		 364 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  35.96 
 
 		 364 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  34.36 
 
 		 501 aa  161  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 473 aa  161  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  32.44 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 639 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 470 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 639 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  34.17 
 
 		 391 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.48 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.74 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.19 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  34.88 
 
 		 593 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 359 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  30.56 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.49 
 
 		 473 aa  143  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  34.64 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  35.37 
 
 		 354 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 641 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.88 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.82 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  35.59 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 504 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  32.78 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.14 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  31.88 
 
 		 565 aa  137  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  31.45 
 
 		 450 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  32.05 
 
 		 360 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.21 
 
 		 423 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.35 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>