More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0975 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 271 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0885  transcriptional regulator, AraC family  48.41 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2961  transcriptional regulator, AraC family  45.14 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0159613  hitchhiker  0.000452365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 760 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.42 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.28 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  29.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.28 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.41 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.73 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.73 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.73 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.73 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.73 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  32.5 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.62 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  33.03 
 
 		 144 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  35.51 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.12 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  24.91 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  25 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.67 
 
 		 1418 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1161  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000709496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.21 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  33.1 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  24.27 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.28 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  36.63 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3661  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.44 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  25 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.77 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  29.74 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  20.8 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0360  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>