260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0921 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  100 
 
 
350 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  61.86 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  58.45 
 
 
359 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  59.6 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  57.31 
 
 
352 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  57.43 
 
 
365 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  56.53 
 
 
362 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  58.43 
 
 
369 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  59.16 
 
 
352 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  58.84 
 
 
368 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  55.34 
 
 
358 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  55.06 
 
 
358 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  55.06 
 
 
358 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  56.32 
 
 
353 aa  346  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  53.94 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  53.92 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  52.6 
 
 
353 aa  319  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  45.86 
 
 
346 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  50.74 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  47.62 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  48.96 
 
 
339 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  49.58 
 
 
387 aa  292  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  48.8 
 
 
352 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  44.05 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  45.75 
 
 
343 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  43.36 
 
 
346 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  45.61 
 
 
343 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  46.33 
 
 
343 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  43.15 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  43.45 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  44.81 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  44.94 
 
 
346 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  41.76 
 
 
346 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  44.31 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  44.41 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  43.58 
 
 
346 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  41.76 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  43.58 
 
 
346 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  43.11 
 
 
361 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  43.11 
 
 
371 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  44.31 
 
 
348 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  43.11 
 
 
361 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  42.94 
 
 
346 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  44.94 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  43.28 
 
 
346 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  39.31 
 
 
353 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.6 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  48.02 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  42.73 
 
 
364 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  41.19 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  43.86 
 
 
348 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  40.91 
 
 
351 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  38.17 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  40.12 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  40.12 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  41.82 
 
 
349 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  40.41 
 
 
346 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  41.44 
 
 
347 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  41.84 
 
 
350 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  41.96 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  40 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  41.25 
 
 
347 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  45.52 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  37.65 
 
 
349 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  41.06 
 
 
362 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  39.47 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  41.06 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.43 
 
 
356 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  40.18 
 
 
341 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  36.71 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  37.35 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  40.47 
 
 
341 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  33.62 
 
 
355 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.97 
 
 
353 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  41.12 
 
 
341 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  34.5 
 
 
350 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  37.14 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  37.43 
 
 
351 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  34.5 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  35.88 
 
 
345 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  38.11 
 
 
353 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  33.43 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  33.24 
 
 
349 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  40.47 
 
 
350 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  38.79 
 
 
350 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  33.63 
 
 
350 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  35.82 
 
 
338 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  31.69 
 
 
350 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  38.98 
 
 
357 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  32.43 
 
 
342 aa  165  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  33.92 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  31.79 
 
 
349 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  32.63 
 
 
338 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  32.05 
 
 
339 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.46 
 
 
344 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  29.41 
 
 
351 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  31.98 
 
 
348 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  36.05 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  34.16 
 
 
336 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  31.14 
 
 
346 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>