209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0908 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  56.94 
 
 		 569 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  55.2 
 
 		 622 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  60.42 
 
 		 564 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  58.49 
 
 		 657 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  64.09 
 
 		 562 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  64.48 
 
 		 591 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.89 
 
 		 593 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.22 
 
 		 570 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  64.48 
 
 		 591 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  64.12 
 
 		 578 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  64.48 
 
 		 591 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  64.12 
 
 		 578 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  60.28 
 
 		 563 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 577 aa  1185    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  64.27 
 
 		 578 aa  735    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  63.51 
 
 		 587 aa  716    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 		 567 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.04 
 
 		 562 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  56.46 
 
 		 581 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  59.54 
 
 		 563 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.89 
 
 		 623 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.11 
 
 		 586 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.65 
 
 		 583 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.58 
 
 		 557 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  59.27 
 
 		 556 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55 
 
 		 582 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.58 
 
 		 567 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.54 
 
 		 565 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.41 
 
 		 543 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.22 
 
 		 543 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  46.04 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.59 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.53 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  42.52 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  42.52 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  41.99 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  42.52 
 
 		 653 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  42.52 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  42.52 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  42.52 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  42.52 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.33 
 
 		 786 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 889 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  31.2 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.83 
 
 		 1150 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.48 
 
 		 572 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  27 
 
 		 1150 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  26.33 
 
 		 554 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 		 552 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.17 
 
 		 551 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 		 527 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.59 
 
 		 1132 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  25.6 
 
 		 530 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.14 
 
 		 526 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  25.14 
 
 		 528 aa  88.6  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.67 
 
 		 1152 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.55 
 
 		 553 aa  87  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  29.81 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.94 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1152 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  26.15 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  29.83 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  28.49 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.15 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  28.61 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  28.21 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.15 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.82 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.36 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  26.89 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.73 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.45 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.37 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  29.55 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  27.3 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.04 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  24.56 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  23.29 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  21.73 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.53 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.12 
 
 		 541 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  24.07 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  26.82 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.48 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.13 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.2 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.36 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  27.61 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  20.99 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.04 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>