31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0897 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  899    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  37.44 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  33.48 
 
 		 420 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  34.34 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  33.03 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  30.67 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  33.56 
 
 		 355 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  27.97 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  28.67 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  25.97 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  25.65 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  32.86 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  26.03 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  25.81 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  28.62 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  28.21 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  31.12 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  25.49 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  25.25 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  26.8 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  24.47 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  24.74 
 
 		 197 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  21.15 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  23.65 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  37.88 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  21.99 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  21.99 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  22.31 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  26.85 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  32.22 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  23.16 
 
 		 364 aa  43.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>