87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0894 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
278 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  48.85 
 
 
274 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  49 
 
 
273 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
271 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  47.58 
 
 
264 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  45.15 
 
 
310 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  47.7 
 
 
273 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  44.24 
 
 
288 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  48.97 
 
 
275 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 
285 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 
268 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  49.8 
 
 
273 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  46.06 
 
 
271 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  46.98 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  44.36 
 
 
315 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  45.64 
 
 
271 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 
272 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 
272 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 
282 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  44.67 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  44.58 
 
 
262 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  44.02 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 
261 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  43.63 
 
 
282 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 
282 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  44.72 
 
 
267 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  42.13 
 
 
267 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  44.49 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  42.45 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  44.18 
 
 
273 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  45.06 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
264 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 
264 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  43.97 
 
 
270 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  43.25 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  44.31 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  43.57 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  39.21 
 
 
313 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  41.63 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
270 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 
288 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  41.37 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  45.87 
 
 
265 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  34.91 
 
 
294 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  37 
 
 
296 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 
318 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 
302 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 
276 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  35.47 
 
 
283 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 
254 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  35.52 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
305 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 
271 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  35.83 
 
 
281 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  40.16 
 
 
277 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  34.09 
 
 
272 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  32.36 
 
 
263 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 
241 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.71 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  30.96 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 
48 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10023  transcriptional regulator  37.31 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 
97 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 
227 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
761 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  26.03 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
135 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  36.49 
 
 
131 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
185 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 
130 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
105 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 
101 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>