29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0864 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  100 
 
 		 497 aa  937    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  33.78 
 
 		 515 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  28.94 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  29.46 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13485  integral membrane protein  28.32 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.558357  hitchhiker  0.00735127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  25.88 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  28.52 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  26.37 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  29.33 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  24.29 
 
 		 528 aa  57  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  37.37 
 
 		 484 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  30.09 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  32.77 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0082  hypothetical protein  30.09 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201998  decreased coverage  0.00368698 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  33.88 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  25.1 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  30.24 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  35.07 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  33.66 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  32.38 
 
 		 468 aa  50.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  33.63 
 
 		 441 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  33.65 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  33.08 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  27.55 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  27.21 
 
 		 465 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  29.46 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  30.08 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  29.08 
 
 		 465 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>