More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0841 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  100 
 
 
440 aa  888    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  70.67 
 
 
444 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  70.19 
 
 
453 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  65.17 
 
 
441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  65.48 
 
 
438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  68.1 
 
 
437 aa  564  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  62.88 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  61.84 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  62.76 
 
 
435 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  60.55 
 
 
461 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  59.59 
 
 
462 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  59.34 
 
 
441 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  59.48 
 
 
463 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  60.19 
 
 
484 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  61.65 
 
 
459 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  61.65 
 
 
459 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  61.65 
 
 
459 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  55.61 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  54.12 
 
 
437 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  53.1 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  53.36 
 
 
446 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  41.3 
 
 
444 aa  356  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  40 
 
 
446 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  38.76 
 
 
450 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  45.09 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  45.09 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  38.37 
 
 
448 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  43.53 
 
 
428 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  31.98 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  36.94 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  39.78 
 
 
443 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  36.08 
 
 
443 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.58 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.06 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  35.57 
 
 
450 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.2 
 
 
457 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  35.44 
 
 
448 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  37.04 
 
 
464 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  35.63 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.35 
 
 
446 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  35.07 
 
 
454 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.35 
 
 
446 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.35 
 
 
446 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.35 
 
 
446 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34.33 
 
 
448 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.39 
 
 
446 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  35.63 
 
 
454 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  35.35 
 
 
446 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  35.82 
 
 
448 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  35.82 
 
 
448 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 
428 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  35.58 
 
 
448 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  34.77 
 
 
449 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  34.41 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  37.65 
 
 
447 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.85 
 
 
456 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  35.28 
 
 
462 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  35.41 
 
 
454 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  36.96 
 
 
440 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  36.71 
 
 
468 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  34.22 
 
 
461 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  37.05 
 
 
444 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  35.97 
 
 
451 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.56 
 
 
470 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  38.21 
 
 
447 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  34.53 
 
 
449 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  34.22 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  34.22 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  35.89 
 
 
456 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  33.79 
 
 
451 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  36.34 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  35.45 
 
 
448 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  33.03 
 
 
465 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.49 
 
 
436 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  37.7 
 
 
445 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  37.17 
 
 
443 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  33.72 
 
 
394 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  34.09 
 
 
471 aa  216  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  33.69 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.38 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  33.03 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  31.91 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  31.52 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  35.38 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  34.03 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  34.03 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  34.25 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  34.03 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  32.47 
 
 
453 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  32.47 
 
 
453 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1002  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.15 
 
 
491 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  35.7 
 
 
446 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  35.66 
 
 
443 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  34.87 
 
 
455 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.072939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>