163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0807 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  100 
 
 
566 aa  1135    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  38.85 
 
 
519 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  31.2 
 
 
484 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  30.96 
 
 
567 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  27.52 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  28.72 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.46 
 
 
511 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.46 
 
 
488 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  27.68 
 
 
508 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  27.68 
 
 
508 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  28.75 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  27.57 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  27.93 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  28.13 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  27.09 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  27.06 
 
 
508 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  27.06 
 
 
508 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  28.41 
 
 
524 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  28.97 
 
 
464 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  27.21 
 
 
491 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  27.21 
 
 
491 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  27.21 
 
 
491 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  27 
 
 
516 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  27.79 
 
 
517 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  27.31 
 
 
532 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  27.86 
 
 
519 aa  100  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  31.45 
 
 
441 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  27.37 
 
 
506 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  29.61 
 
 
550 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  26.1 
 
 
578 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  30.1 
 
 
519 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  26.42 
 
 
473 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  25.24 
 
 
578 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  36.78 
 
 
480 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  36.78 
 
 
480 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  24.9 
 
 
579 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  25.96 
 
 
581 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  25.96 
 
 
581 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  33 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  34.12 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  36.08 
 
 
561 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  34.12 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  28.69 
 
 
593 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.71 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  28.69 
 
 
593 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  36.08 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  40.34 
 
 
521 aa  77  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  41.94 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  36.48 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  38.17 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  35 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  36.28 
 
 
618 aa  73.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  37.5 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  34.27 
 
 
427 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.78 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.12 
 
 
535 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.51 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.88 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  32.63 
 
 
571 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  39.66 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  45.45 
 
 
709 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.29 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  39.17 
 
 
620 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  36.96 
 
 
585 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  38.94 
 
 
593 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  38.94 
 
 
601 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.8 
 
 
584 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  36.3 
 
 
748 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  39.83 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  38.05 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.22 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  45.83 
 
 
743 aa  67.8  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  36.13 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  36.84 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.09 
 
 
516 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  37.19 
 
 
523 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  25.87 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  37.36 
 
 
620 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  32.58 
 
 
586 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  25.19 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  46.3 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  24.62 
 
 
433 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  24.27 
 
 
567 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  36.17 
 
 
714 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  34.81 
 
 
602 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  35.62 
 
 
556 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  38.02 
 
 
507 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.9 
 
 
512 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  45 
 
 
485 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  31.72 
 
 
426 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  25.19 
 
 
428 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.61 
 
 
553 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  36.96 
 
 
117 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  34.25 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  30.21 
 
 
557 aa  58.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  33.56 
 
 
443 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  30.21 
 
 
602 aa  57.4  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  36.72 
 
 
508 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  24.5 
 
 
433 aa  57.4  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  24.94 
 
 
440 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>