More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0790 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
483 aa  964    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.61 
 
 
489 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.61 
 
 
489 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  61.61 
 
 
489 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.34 
 
 
503 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.51 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.64 
 
 
222 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.55 
 
 
232 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.25 
 
 
502 aa  266  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  59.55 
 
 
234 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  59.55 
 
 
235 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  59.55 
 
 
235 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.45 
 
 
502 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  60 
 
 
226 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  60 
 
 
232 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.09 
 
 
232 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.07 
 
 
217 aa  257  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  60.77 
 
 
209 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  60.77 
 
 
209 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  60.77 
 
 
209 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  60.29 
 
 
209 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.11 
 
 
245 aa  249  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  54.75 
 
 
245 aa  243  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.63 
 
 
221 aa  239  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0211  amino acid ABC transporter, permease  53.39 
 
 
238 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.55 
 
 
513 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  55.29 
 
 
219 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  32.33 
 
 
501 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.52 
 
 
226 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2004  amino acid ABC transporter, permease protein  48.23 
 
 
239 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  30.4 
 
 
727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  30.56 
 
 
736 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  50.93 
 
 
228 aa  217  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0780  amino-acid ABC transporter permease protein YckJ  50 
 
 
210 aa  217  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  56.12 
 
 
226 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  50 
 
 
222 aa  217  5e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 
273 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.56 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.23 
 
 
226 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.58 
 
 
226 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  28.18 
 
 
714 aa  213  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2438  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.9 
 
 
239 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2486  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.9 
 
 
239 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
225 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
225 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.99 
 
 
226 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.65 
 
 
492 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.05 
 
 
226 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
485 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
485 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 
225 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.47 
 
 
510 aa  204  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0683  amino acid ABC transporter, permease protein  56.12 
 
 
226 aa  204  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
260 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  55.93 
 
 
221 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  40.5 
 
 
257 aa  203  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  54.8 
 
 
222 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  27.69 
 
 
485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  47.49 
 
 
268 aa  200  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  38.11 
 
 
265 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.98 
 
 
222 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0357  amino acid ABC transporter permease  54.24 
 
 
222 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.98 
 
 
222 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.86 
 
 
260 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.71 
 
 
257 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
226 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.120537 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.71 
 
 
257 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.2 
 
 
218 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 
257 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2526  amino acid ABC transporter permease  50.23 
 
 
226 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.25 
 
 
490 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.96 
 
 
222 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 
265 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.22 
 
 
260 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  41.07 
 
 
257 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 
221 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 
221 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3139  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
226 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6490  amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.23 
 
 
226 aa  193  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598296  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  38 
 
 
257 aa  193  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  39.62 
 
 
260 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  48.15 
 
 
222 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.6 
 
 
265 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1168  amino acid ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease protein  48.15 
 
 
222 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.066667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2108  amino acid ABC transporter His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease  48.15 
 
 
222 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0113123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 
221 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
222 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  51.02 
 
 
218 aa  190  4e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  48.15 
 
 
222 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  40.62 
 
 
257 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 
260 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  42.04 
 
 
260 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>