More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0667 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 445 aa  862    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  66.06 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  62.56 
 
 		 455 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  61.3 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  61.99 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  62.1 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  62.1 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  62.1 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  57.79 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  51.94 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  51.23 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  46.91 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  47.75 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  51.25 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  51.83 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 455 aa  359  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  50.47 
 
 		 455 aa  358  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  45.33 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  47.69 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  45.68 
 
 		 473 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  47.95 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  47.69 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  47.17 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  44.82 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  45.31 
 
 		 456 aa  292  8e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.13 
 
 		 464 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.6 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.48 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.98 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.4 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.66 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.51 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  32.73 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  36.95 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.32 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.95 
 
 		 461 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.05 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.05 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.71 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  30.95 
 
 		 428 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  31.07 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  35.35 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.26 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 453 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  30.5 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.78 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.86 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  28.51 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.88 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  30.25 
 
 		 527 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  29.43 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>