More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0618 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
400 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.26 
 
 
402 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.15 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  48.27 
 
 
393 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.15 
 
 
393 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.88 
 
 
393 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.88 
 
 
393 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.88 
 
 
393 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.88 
 
 
393 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  51.31 
 
 
391 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  46.48 
 
 
397 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  39.95 
 
 
397 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.73 
 
 
392 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  35.48 
 
 
373 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
396 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  39.24 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  46.72 
 
 
272 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  37.13 
 
 
389 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  39.14 
 
 
386 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  35.17 
 
 
393 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  37.43 
 
 
396 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  45.71 
 
 
272 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  37.43 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  46.34 
 
 
287 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  45.34 
 
 
251 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  44.73 
 
 
260 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.87 
 
 
161 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.6 
 
 
154 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 
261 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  36.17 
 
 
256 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  35.6 
 
 
260 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 
256 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  35.66 
 
 
265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.84 
 
 
130 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.84 
 
 
130 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.84 
 
 
130 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  54.03 
 
 
133 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  36.17 
 
 
256 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.03 
 
 
132 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.74 
 
 
128 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.03 
 
 
130 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.03 
 
 
130 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
128 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  35.77 
 
 
261 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
128 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
128 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
128 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
128 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.62 
 
 
128 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.47 
 
 
128 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  34.65 
 
 
255 aa  136  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.65 
 
 
132 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.34 
 
 
122 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  50.39 
 
 
133 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  37.15 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.65 
 
 
132 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.1 
 
 
128 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.28 
 
 
133 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.42 
 
 
129 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.28 
 
 
128 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  32.44 
 
 
261 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
128 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.28 
 
 
128 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  51.59 
 
 
129 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.59 
 
 
129 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.59 
 
 
129 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  54.03 
 
 
131 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.24 
 
 
128 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  50.39 
 
 
132 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  34.45 
 
 
261 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.23 
 
 
132 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  36.21 
 
 
425 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  52.89 
 
 
130 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
261 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  34.31 
 
 
261 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
261 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.07 
 
 
131 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
261 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35.68 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  36 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.54 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 
260 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
134 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.56 
 
 
136 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
262 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  34.36 
 
 
259 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 
261 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.16 
 
 
114 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
134 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
279 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
256 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.74 
 
 
132 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  35.34 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.55 
 
 
135 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  32.02 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.92 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>