More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0536 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0536  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 
400 aa  819    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.93 
 
 
411 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  74.24 
 
 
404 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  72.08 
 
 
407 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.56 
 
 
412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.81 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.81 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  68.35 
 
 
406 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  69.52 
 
 
402 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.76 
 
 
402 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3476  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.09 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.9 
 
 
417 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.88 
 
 
404 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.21 
 
 
410 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.34 
 
 
419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.81 
 
 
394 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.2 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.71 
 
 
406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.87 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.55 
 
 
413 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.56 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  51.17 
 
 
392 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.57 
 
 
394 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.26 
 
 
396 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 
397 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  51.03 
 
 
402 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.32 
 
 
394 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.3 
 
 
408 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 
401 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.13 
 
 
406 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.06 
 
 
394 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.95 
 
 
402 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.7 
 
 
404 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.74 
 
 
408 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.23 
 
 
408 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.22 
 
 
422 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.33 
 
 
394 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.44 
 
 
393 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.51 
 
 
394 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 
414 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.85 
 
 
396 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.7 
 
 
403 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.51 
 
 
397 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.13 
 
 
398 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.13 
 
 
401 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.57 
 
 
398 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.27 
 
 
404 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.93 
 
 
401 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.27 
 
 
404 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.22 
 
 
396 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.46 
 
 
393 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.43 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.85 
 
 
395 aa  359  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.97 
 
 
396 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.72 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.72 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.72 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.14 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.85 
 
 
410 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0638  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.44 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121257  normal  0.711879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.71 
 
 
392 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.85 
 
 
410 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.52 
 
 
389 aa  351  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.3 
 
 
397 aa  348  7e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.92 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.95 
 
 
401 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  43.26 
 
 
388 aa  345  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.87 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.87 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.87 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.87 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.87 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.78 
 
 
404 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.21 
 
 
396 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.21 
 
 
396 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.31 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.37 
 
 
405 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.42 
 
 
396 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.69 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  44.9 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.42 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.19 
 
 
397 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.17 
 
 
406 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.69 
 
 
402 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.6 
 
 
411 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.99 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.17 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 
403 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.19 
 
 
413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 
397 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.48 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  43.93 
 
 
396 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  40.67 
 
 
391 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  40.57 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.86 
 
 
396 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.9 
 
 
399 aa  318  9e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.46 
 
 
403 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.81 
 
 
411 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 
403 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>