More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0525 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  49.18 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  47.51 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  46.48 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  46.2 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  44.33 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  44.33 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  44.33 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  45.36 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  43.97 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  45.33 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  42.72 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  42.86 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  44.05 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  42.86 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  43.45 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  42.54 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  41.53 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  39.22 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  41.12 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  35.83 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  41.07 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  39.31 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  37.58 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  39.06 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  44.31 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  39.48 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  35.37 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  34.82 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  35.05 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  35.56 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.1 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  31.38 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.59 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.04 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  32.38 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  34.91 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  31.7 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  40.57 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  26.63 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  31.37 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  34.44 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  36.59 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32.55 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  35.58 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  31.89 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.63 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.27 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.58 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.33 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.46 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  34.2 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.93 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.06 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  33.02 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.06 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.42 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  31.99 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.25 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.28 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.41 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.15 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  33.72 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.52 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.91 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.92 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.79 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.53 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>