38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0515 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  752    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  54.22 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  42.86 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  39.66 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  39.42 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  36.31 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  34.22 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  36.39 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  36.73 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  38.49 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  32.41 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  32.39 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  34.88 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  34.56 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  35.21 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  35.04 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  43.19 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  31.5 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  30.73 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  30.68 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  33.6 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  36.92 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  35.04 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  34.02 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  28.44 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  28.44 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  28.11 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  42.54 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  31.28 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  32.62 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  34.67 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  29.41 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  29.27 
 
 		 419 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  28.42 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  29.01 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  21.46 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  35.63 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  26.92 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>