242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0465 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  56.31 
 
 
737 aa  829    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  52.74 
 
 
716 aa  747    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.09 
 
 
717 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  50.2 
 
 
1388 aa  727    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  63.93 
 
 
762 aa  960    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  48.52 
 
 
1046 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.48 
 
 
762 aa  771    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  53.76 
 
 
718 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  49.84 
 
 
882 aa  786    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  47.38 
 
 
699 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.14 
 
 
737 aa  703    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  45.07 
 
 
1033 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  48.52 
 
 
1046 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  46.65 
 
 
1027 aa  770    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.6 
 
 
748 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  70.1 
 
 
1215 aa  1115    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  48.33 
 
 
1042 aa  829    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.89 
 
 
758 aa  1001    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
1131 aa  2271    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  45.99 
 
 
1044 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  49.8 
 
 
727 aa  722    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  54.18 
 
 
732 aa  772    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  48.65 
 
 
716 aa  618  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  44.84 
 
 
739 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.31 
 
 
721 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.87 
 
 
774 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.68 
 
 
743 aa  592  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  40.29 
 
 
683 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.59 
 
 
676 aa  475  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  37.81 
 
 
678 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.17 
 
 
989 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  34.04 
 
 
703 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  33.6 
 
 
703 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.9 
 
 
711 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.78 
 
 
722 aa  396  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  33.99 
 
 
703 aa  393  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  33.99 
 
 
703 aa  393  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  33.86 
 
 
703 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  33.99 
 
 
703 aa  393  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  33.99 
 
 
703 aa  393  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  33.99 
 
 
703 aa  393  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  33.73 
 
 
703 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  33.86 
 
 
703 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.59 
 
 
711 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.57 
 
 
699 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  35.92 
 
 
711 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  35.26 
 
 
727 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.28 
 
 
694 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.88 
 
 
694 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  34.41 
 
 
730 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.28 
 
 
698 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.37 
 
 
686 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.02 
 
 
699 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  34.7 
 
 
629 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  35.61 
 
 
683 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  33.11 
 
 
678 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.63 
 
 
712 aa  363  8e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.84 
 
 
679 aa  359  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.14 
 
 
713 aa  360  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.85 
 
 
655 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.55 
 
 
658 aa  354  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  33.82 
 
 
658 aa  354  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  42.55 
 
 
655 aa  354  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  38.84 
 
 
661 aa  354  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  40.56 
 
 
659 aa  353  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.11 
 
 
656 aa  353  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.47 
 
 
656 aa  353  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  34.12 
 
 
661 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  31.65 
 
 
652 aa  351  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.32 
 
 
658 aa  350  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.98 
 
 
664 aa  350  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.98 
 
 
664 aa  348  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  32.44 
 
 
752 aa  347  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.24 
 
 
683 aa  347  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  34.3 
 
 
714 aa  342  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.45 
 
 
663 aa  340  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.68 
 
 
663 aa  332  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.26 
 
 
661 aa  294  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.94 
 
 
662 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  35.94 
 
 
663 aa  291  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.16 
 
 
641 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.18 
 
 
722 aa  290  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.51 
 
 
714 aa  290  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.29 
 
 
661 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.73 
 
 
662 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  29.22 
 
 
661 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  29.18 
 
 
661 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  29.22 
 
 
661 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  34.63 
 
 
654 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  29.72 
 
 
688 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.31 
 
 
629 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  28.12 
 
 
671 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  34.31 
 
 
703 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.01 
 
 
724 aa  269  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  35.66 
 
 
653 aa  264  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  32.56 
 
 
692 aa  261  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  35.28 
 
 
669 aa  260  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  35.16 
 
 
653 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  37.53 
 
 
633 aa  258  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0847485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  35.16 
 
 
654 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>