18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0452 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  245  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  48.57 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  47.57 
 
 
138 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  35.64 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  37 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  36.26 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  33.62 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  34.86 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  33.61 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  36.05 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  29.66 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  33.64 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  30.68 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  41.43 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  39.18 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  33.03 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  36.05 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>