178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0446 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  100 
 
 		 412 aa  836    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  45.58 
 
 		 624 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  54.86 
 
 		 620 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  52.6 
 
 		 613 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  51.03 
 
 		 624 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  46.45 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  52.86 
 
 		 601 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  45.95 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  51.93 
 
 		 334 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  50.83 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  47.32 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  54.9 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  43.38 
 
 		 608 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  49.66 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  48.14 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  47.8 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  45.09 
 
 		 418 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  49.51 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  52.76 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  48.8 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  45.96 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  43.52 
 
 		 305 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  43.52 
 
 		 305 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  45.03 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  47.77 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  46.37 
 
 		 335 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  46.37 
 
 		 335 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  46.37 
 
 		 335 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  44.14 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  41.56 
 
 		 311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  42.52 
 
 		 307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  45.1 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  41.84 
 
 		 307 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  41.56 
 
 		 645 aa  225  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  43.04 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  43.16 
 
 		 310 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  46.24 
 
 		 317 aa  222  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  42.46 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  42.81 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  44.6 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  42.91 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  43.05 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  39.33 
 
 		 308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  42.52 
 
 		 304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  42.52 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  42.52 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  42.52 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  42.52 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  41.64 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  43.71 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  41.95 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  39.59 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  41.95 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  43.71 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  41.69 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  41.25 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  41.86 
 
 		 304 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  41.53 
 
 		 304 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  39.55 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  41.61 
 
 		 304 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  44.25 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  43 
 
 		 309 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  41.16 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  41.53 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  39.24 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  40.83 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  41.72 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  40.85 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  40.94 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  37.84 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  36.72 
 
 		 307 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  43.06 
 
 		 309 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  37.84 
 
 		 326 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  41.14 
 
 		 306 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  37.16 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  37.16 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  37.16 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  40 
 
 		 304 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  37.16 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  36.82 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  41.81 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  39.6 
 
 		 304 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  36.82 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  42.14 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  39.74 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  40.59 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  40 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  39.37 
 
 		 309 aa  199  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  40.34 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  36.72 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  38.66 
 
 		 316 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  38.41 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  40 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  33.97 
 
 		 309 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>