More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0397 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 856 aa  1646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  43.51 
 
 		 859 aa  562  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  39.19 
 
 		 834 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  36.57 
 
 		 843 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  36.8 
 
 		 842 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.95 
 
 		 848 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  36.35 
 
 		 847 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  37.53 
 
 		 845 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 852 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  37.88 
 
 		 849 aa  360  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  36.54 
 
 		 849 aa  359  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 857 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  35.18 
 
 		 853 aa  348  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 		 853 aa  348  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 873 aa  345  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  35.29 
 
 		 861 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  34.17 
 
 		 836 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 		 855 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  35.7 
 
 		 873 aa  321  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  32.05 
 
 		 854 aa  317  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.09 
 
 		 838 aa  297  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  35.65 
 
 		 866 aa  294  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  34.83 
 
 		 853 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  33.75 
 
 		 806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  33.42 
 
 		 825 aa  263  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.52 
 
 		 841 aa  252  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  31 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  33.02 
 
 		 839 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 846 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.06 
 
 		 821 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  31.12 
 
 		 855 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  34.02 
 
 		 871 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.68 
 
 		 880 aa  207  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 		 855 aa  204  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26 
 
 		 897 aa  194  7e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.93 
 
 		 835 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 		 857 aa  174  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  29.81 
 
 		 828 aa  168  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 		 930 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.2 
 
 		 851 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 		 878 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.17 
 
 		 863 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  24.37 
 
 		 858 aa  150  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.36 
 
 		 850 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.06 
 
 		 870 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 846 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.58 
 
 		 866 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.8 
 
 		 854 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.65 
 
 		 857 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.72 
 
 		 850 aa  122  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 849 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.62 
 
 		 852 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.65 
 
 		 849 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 855 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.7 
 
 		 855 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.32 
 
 		 856 aa  112  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.15 
 
 		 801 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  31 
 
 		 826 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  21.49 
 
 		 829 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  21.49 
 
 		 829 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 822 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 847 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 839 aa  95.5  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  30.92 
 
 		 842 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  20.47 
 
 		 684 aa  93.6  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 		 842 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 828 aa  87.4  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 		 842 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  25.44 
 
 		 841 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  42.06 
 
 		 859 aa  85.1  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 404 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.97 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.58 
 
 		 858 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  25.74 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  23.77 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  23.77 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.77 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.19 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.19 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.61 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21 
 
 		 850 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 383 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 391 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 		 384 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.33 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.22 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.79 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  23.28 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 849 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  23.27 
 
 		 852 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.15 
 
 		 371 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.79 
 
 		 393 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  23.27 
 
 		 852 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.17 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  22.6 
 
 		 383 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.48 
 
 		 794 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>