15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0334 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0334  hypothetical protein  100 
 
 
717 aa  1388    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3296  hypothetical protein  31.07 
 
 
586 aa  120  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0120256  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5453  hypothetical protein  29.89 
 
 
702 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5782  hypothetical protein  27.78 
 
 
568 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0817507  normal  0.0904158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0756  hypothetical protein  26.42 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0091  hypothetical protein  27.87 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466213  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0077  hypothetical protein  28.2 
 
 
465 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0086  hypothetical protein  28.2 
 
 
465 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.884543  normal  0.0136026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0067  hypothetical protein  27.96 
 
 
465 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0999093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11828  hypothetical protein  29.27 
 
 
406 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13917  hypothetical protein  26.37 
 
 
462 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.791401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13920  hypothetical protein  26.85 
 
 
537 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5562  hypothetical protein  25.98 
 
 
519 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924525  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5965  hypothetical protein  25.98 
 
 
519 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.151994  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.46 
 
 
2914 aa  48.1  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>