More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0095 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  56.22 
 
 
783 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1840  sulphate transporter  52.49 
 
 
769 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000017022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  100 
 
 
726 aa  1411    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13302  transmembrane carbonic anhydrase  55.46 
 
 
764 aa  704    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  47.06 
 
 
749 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  48.45 
 
 
867 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  48.2 
 
 
787 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  44.97 
 
 
754 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  44.71 
 
 
739 aa  459  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  50.95 
 
 
877 aa  446  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2232  sulphate transporter  42.63 
 
 
505 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2944  sulphate transporter  41.33 
 
 
522 aa  308  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01050  sulfate transporter  41.3 
 
 
523 aa  305  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01250  putative sulfate transporter  41.31 
 
 
523 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0178  putative sulfate transporter  40.9 
 
 
523 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0115  sulphate transporter  42.48 
 
 
510 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0101  sulphate transporter  42.77 
 
 
505 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5256  sulfate transporter family protein  39.59 
 
 
510 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0119  sulphate transporter  42.66 
 
 
508 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2826  sulphate transporter  41.33 
 
 
522 aa  293  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0809092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3053  sulphate transporter  41.73 
 
 
522 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0116  sulphate transporter  41.63 
 
 
510 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.83315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0081  sulphate transporter  40.04 
 
 
508 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2616  sulphate transporter  41.72 
 
 
512 aa  286  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1554  sulphate transporter  40.86 
 
 
526 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261952  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1925  hypothetical protein  39.5 
 
 
508 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0287  sulphate transporter  38.93 
 
 
510 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0799  sulphate transporter  39.19 
 
 
519 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000429113  normal  0.0740574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  35.02 
 
 
531 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  29.74 
 
 
768 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1269  sulphate transporter  40.22 
 
 
485 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724651  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0642  sulphate transporter  35.91 
 
 
534 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  29.74 
 
 
768 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2472  sulfate transporter family protein  30.97 
 
 
565 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0780  sulphate transporter  32.26 
 
 
548 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5026  sulphate transporter  31.35 
 
 
542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0023678  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  32.93 
 
 
519 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2931  sulphate transporter  30.67 
 
 
525 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3224  sulphate transporter  32.88 
 
 
526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  31.55 
 
 
601 aa  194  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  28.54 
 
 
553 aa  193  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  34.81 
 
 
520 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2099  sulphate transporter  37.27 
 
 
553 aa  192  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2117  hypothetical protein  32.67 
 
 
506 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  31.85 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  27.4 
 
 
756 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  34.17 
 
 
520 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  36.21 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1626  sulphate transporter  29.87 
 
 
549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5586  sulphate transporter  34.14 
 
 
516 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1416  sulphate transporter  35.56 
 
 
498 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2142  hypothetical protein  32.67 
 
 
506 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4764  sulphate transporter  31.58 
 
 
549 aa  180  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02110  Sulfate transporter  31 
 
 
531 aa  178  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2258  sulphate transporter  34.15 
 
 
516 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1647  sulphate transporter  34.15 
 
 
516 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0463  sulphate transporter  33.97 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0286  sulfate transporter family protein  33.97 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2282  sulphate transporter  34.15 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1443  sulfate transporter family protein  34.44 
 
 
533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00222579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17900  sulphate transporter  31.61 
 
 
532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.521856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  32.35 
 
 
556 aa  174  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2175  sulphate transporter  34.36 
 
 
516 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1019  sulphate transporter  33.91 
 
 
527 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.193765  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  33.74 
 
 
575 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  34.66 
 
 
573 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0411  sulphate transporter  34.17 
 
 
489 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4411  sulphate transporter  31.7 
 
 
560 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  30.48 
 
 
606 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2297  sulphate transporter  34.15 
 
 
516 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1442  sulphate transporter  29.25 
 
 
767 aa  170  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.928724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  31.16 
 
 
568 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  30.98 
 
 
568 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  28.24 
 
 
587 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  28.24 
 
 
587 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  28.24 
 
 
587 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  28.42 
 
 
587 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  30.31 
 
 
550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  27.92 
 
 
585 aa  163  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  29.91 
 
 
567 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  29.8 
 
 
568 aa  163  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  34.08 
 
 
577 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  29.74 
 
 
567 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  30.74 
 
 
551 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  33.54 
 
 
557 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  32.99 
 
 
546 aa  160  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  29.66 
 
 
552 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  36.57 
 
 
580 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  31.75 
 
 
564 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  28.63 
 
 
509 aa  158  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  30.12 
 
 
556 aa  158  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  29.88 
 
 
562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  29.03 
 
 
570 aa  157  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  33.57 
 
 
581 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  28.32 
 
 
588 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  33.18 
 
 
581 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  33.2 
 
 
549 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  32.08 
 
 
553 aa  155  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  33.2 
 
 
549 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  31.26 
 
 
553 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>