More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0093 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  62.07 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  60.09 
 
 		 244 aa  274  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  60.09 
 
 		 244 aa  274  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  61.9 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  59.13 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  59.13 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  59.39 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.47 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  59.13 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  58.7 
 
 		 251 aa  258  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  59.13 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 263 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  57.39 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  56 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  59.46 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.16 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 231 aa  234  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.26 
 
 		 222 aa  234  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.32 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.11 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 237 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.05 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  49.11 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 233 aa  195  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  47.62 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  44.64 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  45.74 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.92 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  43.24 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>