81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0092 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  100 
 
 
307 aa  606  1e-172  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  62.17 
 
 
326 aa  361  7e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  62.5 
 
 
308 aa  360  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  62.17 
 
 
331 aa  360  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  62.17 
 
 
331 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  62.17 
 
 
331 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  49.02 
 
 
322 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.59 
 
 
319 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  35.18 
 
 
319 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  33.97 
 
 
665 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  33.97 
 
 
665 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  33.97 
 
 
665 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  34.15 
 
 
681 aa  147  2e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  34.39 
 
 
687 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  35.62 
 
 
661 aa  135  1e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  33.23 
 
 
692 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  35.31 
 
 
736 aa  129  8e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  34.6 
 
 
672 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.58 
 
 
686 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  31.56 
 
 
678 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  32.25 
 
 
651 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  32.59 
 
 
719 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  30.42 
 
 
718 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  32.86 
 
 
671 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  30.36 
 
 
691 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.55 
 
 
731 aa  122  1e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  33.54 
 
 
679 aa  119  5e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.99 
 
 
654 aa  119  5e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  119  8e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  35.52 
 
 
676 aa  117  2e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  30.63 
 
 
718 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  32.28 
 
 
722 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 
651 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.87 
 
 
675 aa  115  1e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  30.47 
 
 
322 aa  114  2e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  32.35 
 
 
711 aa  113  4e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  29.96 
 
 
310 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  30.47 
 
 
322 aa  110  4e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  30.21 
 
 
664 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.74 
 
 
683 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  32.03 
 
 
632 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  30.63 
 
 
697 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  32.4 
 
 
708 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  29.73 
 
 
708 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  31.25 
 
 
752 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  30.97 
 
 
739 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  27.41 
 
 
671 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  29.43 
 
 
631 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.48 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.81 
 
 
394 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.21 
 
 
613 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.36 
 
 
687 aa  85.5  1e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.28 
 
 
354 aa  84.7  2e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  24.13 
 
 
327 aa  75.5  1e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  25.4 
 
 
637 aa  70.9  3e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  26.32 
 
 
646 aa  70.1  5e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  26.04 
 
 
641 aa  70.1  5e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  26.04 
 
 
641 aa  70.1  5e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  25.82 
 
 
642 aa  67  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  30.39 
 
 
651 aa  65.9  9e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  30.08 
 
 
273 aa  62  1e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.22 
 
 
254 aa  60.5  4e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.08 
 
 
315 aa  57  4e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  24.15 
 
 
265 aa  56.2  6e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  55.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  23.48 
 
 
265 aa  55.5  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  25.09 
 
 
270 aa  53.5  5e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  21.67 
 
 
274 aa  53.1  6e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  23.13 
 
 
277 aa  52.8  7e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  26.13 
 
 
387 aa  52.8  7e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  23.13 
 
 
277 aa  52.8  7e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.23 
 
 
290 aa  51.2  2e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  23.91 
 
 
264 aa  49.7  7e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  24 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  22.26 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  22.82 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  24.02 
 
 
322 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  24.72 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.87 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  25.79 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  22.09 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>