136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0085 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  37.79 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  28.4 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.19 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4473  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  33.78 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.09 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>