32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0079 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 391 aa  814    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  60.76 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  45.08 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  35.22 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  26.78 
 
 		 831 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  27.66 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  27.13 
 
 		 814 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  29.08 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  29.06 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  27.12 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  29.47 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  25.83 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  24.22 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  31.58 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  25.37 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  25.62 
 
 		 525 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  30.7 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.52 
 
 		 551 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  27.45 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 		 847 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.55 
 
 		 673 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  26.85 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  28.93 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.72 
 
 		 869 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  24.79 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  28.37 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.68 
 
 		 863 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  22.77 
 
 		 705 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>