17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0078 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  878  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  45.08 
 
 
391 aa  349  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  40.33 
 
 
400 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  28.54 
 
 
399 aa  141  2e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  29 
 
 
333 aa  70.5  5e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
340 aa  61.6  3e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  22.59 
 
 
347 aa  53.5  6e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.77 
 
 
673 aa  50.8  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
556 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  25.1 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  31.58 
 
 
601 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  25.41 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  21.51 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  25.2 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  8.12873e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 
831 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.61 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>