13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0066 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  100 
 
 		 438 aa  855    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  39.53 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  29.52 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  28.23 
 
 		 679 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  28.88 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  33.82 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  26.16 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 476 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  26.12 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  29.77 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>