30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0061 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 523 aa  1026    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  44.68 
 
 		 488 aa  343  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  27 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 413 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2403  O-antigen and teichoic acid export protein  29.45 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000847308  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 482 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 426 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6486  virulence factor MVIN family protein  26.87 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>