22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0056 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0056  protein of unknown function DUF1361  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2131  protein of unknown function DUF1361  33.64 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2227  hypothetical protein  32.04 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0812019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4887  protein of unknown function DUF1361  39.26 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199245  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0075  protein of unknown function DUF1361  29.5 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1187  protein of unknown function DUF1361  39.29 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0559  hypothetical protein  37.58 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.102514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2580  hypothetical protein  32.96 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1444  hypothetical protein  33.1 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4604  protein of unknown function DUF1361  37.84 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0995444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0485  protein of unknown function DUF1361  33.11 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1074  hypothetical protein  36.28 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.542147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1536  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459594 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0364  hypothetical protein  28.47 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.355132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0722  protein of unknown function DUF1361  31.21 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0546  protein of unknown function DUF1361  25.75 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0351  hypothetical protein  28.93 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0733  hypothetical protein  28.29 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.651475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0717  hypothetical protein  28.29 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4891  hypothetical protein  25.35 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32940  predicted membrane protein  29.25 
 
 		 248 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0704439  normal  0.479689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1392  hypothetical protein  27.51 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00205687  normal  0.215484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>