More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0055 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0055  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0829752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2349  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  78.89 
 
 
290 aa  457  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0181385  hitchhiker  0.00000600969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2557  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  77.89 
 
 
287 aa  454  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0967265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2410  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  75.52 
 
 
290 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.140851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09040  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  77.24 
 
 
292 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00724889  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2688  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  75.09 
 
 
287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1190  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  75.79 
 
 
294 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0596  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  73.79 
 
 
291 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3295  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.58 
 
 
289 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.092975  normal  0.141997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.58 
 
 
287 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0423586  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10339  alpha-D-glucose-1-phosphate thymidylyltransferase rmlA  69.47 
 
 
288 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.62 
 
 
291 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0436  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  70.18 
 
 
287 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  69.82 
 
 
287 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0590699  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0285  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  70.53 
 
 
287 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00700603  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0446  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  70.18 
 
 
287 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02720  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.36 
 
 
307 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.71 
 
 
289 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 
286 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.03 
 
 
288 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.02 
 
 
289 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.37 
 
 
312 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0637  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  66.67 
 
 
310 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
286 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0331  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.55 
 
 
291 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.284071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
288 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 
294 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.58 
 
 
298 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 
298 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.91 
 
 
289 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.79 
 
 
290 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 
298 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.56 
 
 
289 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.94 
 
 
292 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
307 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
297 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.54 
 
 
293 aa  371  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 
288 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
292 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
292 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
296 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
293 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
296 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0416  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  61.72 
 
 
292 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
312 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 
301 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
296 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
299 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4306  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.26 
 
 
290 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.89 
 
 
292 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.99 
 
 
291 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
293 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
293 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  62.46 
 
 
293 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
312 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 
293 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
294 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338319  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
292 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
292 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
296 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
296 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
292 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
297 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
305 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
295 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
290 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
295 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.374251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
293 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
294 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
295 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
305 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  59.44 
 
 
295 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
297 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
297 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  60.84 
 
 
292 aa  362  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.39 
 
 
293 aa  362  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.390759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
291 aa  362  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1989  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
287 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
293 aa  361  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
297 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1781  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.7 
 
 
298 aa  361  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000367124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
293 aa  361  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
297 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
296 aa  360  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.56 
 
 
297 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.62 
 
 
291 aa  360  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.22 
 
 
286 aa  360  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 
292 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>