More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0040 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 235 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  27.34 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  27.95 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 304 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  30.14 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 307 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 333 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 315 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 249 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  33.02 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  33.75 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  39.34 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.65 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 267 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 228 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>