27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0038 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0038  flavoprotein  100 
 
 
172 aa  350  6e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1816  flavoprotein  45.27 
 
 
183 aa  120  1e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3994  hypothetical protein  43.92 
 
 
184 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1674  hypothetical protein  40.69 
 
 
182 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3358  hypothetical protein  38.73 
 
 
198 aa  94.4  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0194  hypothetical protein  40.43 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1130  hypothetical protein  33.56 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3598  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  84.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1630  flavoprotein  36.09 
 
 
169 aa  82.4  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5281  flavoprotein  34.72 
 
 
181 aa  81.6  5e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0396  hypothetical protein  35.21 
 
 
186 aa  79  3e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4819  flavoprotein  36.55 
 
 
196 aa  79  3e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.902814  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8590  flavoprotein  34.25 
 
 
177 aa  74.7  6e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388275  normal  0.325413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1647  flavoprotein  32.61 
 
 
168 aa  70.5  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.16464  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0670  flavoprotein  29.79 
 
 
166 aa  65.9  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2077  flavoprotein  29.86 
 
 
184 aa  65.1  5e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30320  phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase  33.56 
 
 
192 aa  63.9  1e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2851  flavoprotein  31.29 
 
 
191 aa  62  4e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5222  flavoprotein  33.33 
 
 
181 aa  60.8  9e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0727824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2580  flavoprotein  30.28 
 
 
191 aa  58.9  3e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0922  phosphopantothenate-cysteine ligase / phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  40 
 
 
377 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  43.55 
 
 
412 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1884  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.39 
 
 
379 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1187  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  28.47 
 
 
414 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3256  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  39.06 
 
 
419 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.530562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1236  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  36.51 
 
 
376 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.310838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0800  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  24.82 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>