More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0029 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 504 aa  1023    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  58.08 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  57.14 
 
 		 495 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  58.08 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  58.08 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  57.49 
 
 		 491 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  56.26 
 
 		 491 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  56.94 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  50.3 
 
 		 489 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.02 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  48.23 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  45.74 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.26 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  45.92 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.6 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.54 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  44.01 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.18 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.88 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.55 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.99 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.53 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.23 
 
 		 490 aa  345  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.51 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.8 
 
 		 487 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  37.62 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.46 
 
 		 481 aa  282  9e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.35 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  36.84 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 		 486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.98 
 
 		 490 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 486 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.59 
 
 		 473 aa  243  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 972 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  33.27 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.04 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  35.61 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.03 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  31.74 
 
 		 933 aa  199  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 573 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.73 
 
 		 954 aa  187  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.28 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  29.43 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.09 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  30.72 
 
 		 921 aa  172  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 		 924 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 		 570 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 		 535 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 578 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 577 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 		 701 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 		 611 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 610 aa  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 		 645 aa  150  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 647 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 645 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 597 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.29 
 
 		 646 aa  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  29.53 
 
 		 640 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.97 
 
 		 574 aa  146  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 628 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 		 643 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 671 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  32.39 
 
 		 615 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 		 646 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 		 586 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  29.44 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 630 aa  139  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 551 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  29.73 
 
 		 645 aa  136  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 		 700 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 636 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.02 
 
 		 647 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  31.63 
 
 		 663 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 		 636 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.08 
 
 		 695 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  28.75 
 
 		 600 aa  133  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 609 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>