16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0024 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0024  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  261  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0018  hypothetical protein  35.66 
 
 
140 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.681504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1681  hypothetical protein  34.62 
 
 
131 aa  58.2  4e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8341  hypothetical protein  29.77 
 
 
139 aa  56.6  1e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.724069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0015  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  55.1  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0030  hypothetical protein  43.21 
 
 
135 aa  54.3  5e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00280  hypothetical protein  37.4 
 
 
144 aa  54.3  6e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.326036  normal  0.0617221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0816  hypothetical protein  34.92 
 
 
140 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10010  hypothetical protein  33.87 
 
 
141 aa  50.4  8e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4480  hypothetical protein  38.16 
 
 
147 aa  47  8e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0022  hypothetical protein  31.29 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0011  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0011  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0019  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0189767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4994  hypothetical protein  38.27 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  3.93416e-06 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0126  hypothetical protein  36.59 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.626877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>