31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0018 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1803  hypothetical protein  71.43 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1431  hypothetical protein  58.46 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30895  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5842  hypothetical protein  58.46 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0646  hypothetical protein  56.16 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.145386  normal  0.355308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5356  hypothetical protein  53.73 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4841  hypothetical protein  62.71 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5141  hypothetical protein  62.71 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4755  hypothetical protein  62.71 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.507768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2504  hypothetical protein  58.33 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0865553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3022  hypothetical protein  41.33 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2250  hypothetical protein  40.85 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3437  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3174  hypothetical protein  52.08 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507972  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5087  hypothetical protein  52.08 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0798995  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3462  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3465  hypothetical protein  47.92 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0163  hypothetical protein  54.17 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4979  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0359  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177051  normal  0.83641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4866  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377038  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2883  hypothetical protein  45.61 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.973654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5178  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4649  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5888  conserved hypothetical membrane spanning protein  40 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0409145  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5289  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3078  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3241  hypothetical protein  63.64 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.507104  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1542  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.120472 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2601  hypothetical protein  43.08 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00128721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6612  hypothetical protein  42.65 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.227197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>